猿の惑星：創世記(ジェネシス) Rise of the Planet of the Apes (2011)

同じ頃、突然、凶暴になった９番は、フランクリンらに襲い掛かり、研究室から脱出して社内で暴れ始める。

会議室に乱入した９番は、警備員に射殺されてしまい、会社に甚大な被害を与え、責任を追及されたウィルは、研究の中止をジェイコブスに言い渡される。

フランクリンは、実験用のチンパンジーの処分を命ぜられるが、メスの９番が産んだ子供を殺すことが出来ずにそれをウィルに渡す。

仕方なくウィルは、チンパンジーを家に連れ帰ることにして、アルツハイマーを患う、元音楽教師の父チャールズ(ジョン・リスゴー)にそれを見せる。

３年後。
チンパンジーは、シーザーと名付けられ、その高い知能は、人間の子供を凌ぐ認知能力を示し、明らかに母親からの遺伝を受け継いでいた。

その間、父チャールズの症状は悪化し、ウィルは、新薬”ALZ-112”を会社から盗み出して父に投与する。

翌朝、早くもその効き目が表れ、チャールズは、ピアノを完璧に弾き、病気が治ったと言って興奮し、ウィルと喜び合う。

シーザーは、隣人のダグラス・ハンシカー(デヴィッド・ヒューレット)の子供達が遊び回る様子に興味を持ち、彼の家に侵入してしまう。

それに気づいたウィルとチャールズは、ハンシカーに傷つけられそうになったシーザーを助けて連れ戻す。

シーザーが傷を負ったため、ウィルは、”サンフランシスコ動物園”の霊長類学者キャロライン・アランハ(フリーダ・ピントー)に診せる。

キャロラインは、ウィルに意思を伝えようとするシーザーに驚き、それ以来、二人は親交を深めていく。

ウィルの自宅に招かれたキャロラインは、屋根裏を改造したシーザーの部屋に案内されるが、チンパンジーの危険性なども彼女は指摘する。

ウィルは、キャロラインの助言もあり、チャールズを伴い、シーザーを”ミュアウッズ国定公園”に連れて行き自由に遊ばせる。

５年後。
成長したシーザーが、自分がペットでないことを意識したため、ウィルは、彼が産まれた会社”ジェネシス”前に連れて行く。

ウィルは、恋人となったキャロラインの前で、母親や父チャールズに投与した薬のせいで、シーザーの知能が発達していることを伝える。

戸惑うキャロラインにウィルは、自宅で続けていた研究の全てを伝える。

キャロラインは、それが危険なことだと指摘するが、ウィルは、新薬による奇跡が、希望を生み出していることを主張する。

その後、チャールズの体内では、”ALZ-112”に対して病気が反撃を始め、症状が元に戻り始める。

そんな時チャールズは、ハンシカーの車を自分のものと思い込み、運転して傷つけてしまう。

怒ったハンシカーはチャールズに言い寄るが、それを見ていたシーザーは、ハンシカーに襲い掛かり、彼を痛めつけてしまう。

シーザーは拘束されて、霊長類保護センターに収容されることになり、ウィルは、責任者のジョン・ランドン(ブライアン・コックス)に彼を預けることになる。

ウィルとキャロラインが帰った直後、シーザーは、ランドンの息子ドッジに、狭い檻に入れられてしまう。

シーザーがいなくなったこともあり、チャールズは病気が進行してしまい、父を助けようとしたウィルは、彼に”ALZ-112”を試し、効果があったことをジェイコブスに話す。

それに驚くジェイコブスは、更に強力な”ALZ”を完成させたことをウィルから知らされるが、新薬が承認されるはずもなく話を聞き流す。

しかしウィルは、”ALZ”が治療だけでなく、認知機能と記憶力を高める効果があることをジェイコブスに伝える。

それを聞いたジェイコブスは態度を一変し、チンパンジーで”ＡＬＺ”をテストするようウィルに指示し、全面的支援を約束する。

センターのシーザーは、劣悪な環境で虐げられた毎日を送り、ウィルや家を想いながら耐えていた。

ウィルの実験は始まり、選ばれた”ボノボ”のコバ(クリストファー・ゴードン)に”ALZ-113”が投与される。

しかし、フランクリンが、ガス状の”ALZ-113”れを誤って吸ってしまう。

その後コバは、ジェイコブスの名前を文字で書き、それを知った彼は驚き、実験は続けられる。

その頃シーザーは、オランウータンのモーリス(カリン・コノヴァル)が手話が出来ることを知り、人間いついての情報を得る。

シーザーと面会したウィルは、彼が虐待されていることを確認して、それをランドンに訴える。

しかし、ウィルは裁判所の命令にはさからえず、シーザーに必ず出すとだけ言ってその場を去る。

シーザーは、ウィルに裏切られたと思い込み塞ぎこむ。

その後シーザーは、ドッジの連れて来た友人に近づき、万能ナイフを奪い、それで檻の鍵を開けて脱出する。

シーザーは、”ニシローランドゴリラ”のバック(リチャード・ライディングス)を解放して仲間にする。

その場の支配者だったロケット(テリー・ノタリー)も解放したシーザーは、バックと共に彼を威圧して自分に従わせる。

チャールズは、自分に薬を投与しようとするウィルを制止し、そのまま息を引き取る。

”ALZ-113”に危険を感じ始めたウィルは、コバの成果を確認して興奮するジェイコブスに、それを伝えるが聞き入れられず辞職する。

発病したフランクリンはウィルの家に向かい、彼が留守だと分かるが、ハンシカーに接触してしまう。

ランドンに大金を払ったウィルは、シーザーを引き取ろうとするものの、彼は檻を出ることを拒む。

その後もシーザーは、人間に対抗するための勢力を確保するため、指導者として仲間達を統率していく。

ある夜、センターを脱出したシーザーは、ウィルの家に向かい”ALZ-113”を盗みだし、そのガスをセンター内で噴出させる。

翌日、異変に気づいたドッジは、係員のロドニー(ジェイミー・ハリス)を見張り台に向わせ、檻から出たシーザーを威嚇する。

シーザーは、襲い掛かってきたドッジの手を掴み、それを離せという彼に対して、”ノー！”と叫び叩きのめす。

仲間達を解放したシーザーは、彼らに痛めつけられていたロドニーが、自分達に友好的だったために救い檻に入れ、抵抗しようとしたドッジを殺す。

チンパンジーが”ジェネシス”に移送されていることを知ったシーザーは、仲間達と共にセンターを脱出する。

翌朝、シーザーの部屋に、誰かが入った形跡あったことから、ウィルはキャロラインと共にセンターに向う。

その場で、ドッジの死体と、”ALZ-113”の容器や檻の中のロドニーを見つけたウィルは、彼からシーザーが言葉を話したことを知らされる。

市民は、大量のチンパンジーなどが移動していることに気づき、センターに着いたランドンは、既に警察により警戒態勢が布かれていることと、監視カメラでの暴動の様子を見て驚く。

シーザーらは”ジェネシス”に乱入し、ジェイコブスには、フランクリンがウイルス感染で死亡したことが伝えられ、人間には、”ALZ-113”に対する免疫のないことが分かる。

出社したジェイコブスは、チンパンジーに囲まれながらも脱出して、駆けつけていた警官に、チンパンジーを殺さなければ、大変な事態になることを伝える。

シーザーらは街の中心地を制圧し、市民はパニックとなりその場を離れ、”ゴールデンゲート・ブリッジ”は渋滞してしまう。

そこにシーザーらが現れ、警官隊は彼らを皆殺しにしようとする。

ウィルとキャロラインもその場に着き、彼は、抵抗しながら橋を渡ろうとするシーザーの元に向おうとする。

武器を持った警官隊に襲い掛かり、撃退したシーザーらは、ジェイコブスの乗ったヘリコプターからの攻撃を受けてしまう。

その場にウィルも現われるが、シーザーはチェーンを使いヘリに攻撃を加える。

シーザーが銃撃されそうになったため、バックがヘリに飛び乗り橋に墜落させる。

銃弾を受けたバックは、シーザーに助け出されるが、彼に見守られながら息を引き取る。

ヘリの中で助けを求めるジェイコブスを無視し、シーザーは、実験に使われたコバにその場を任せる。

コバはヘリを蹴落とし、ジェイコブスは落下死する。

シーザーは、仲間達を引き連れて”ミュアウッズ国定公園”に向かい、ウィルもパトカーでそれを追う。

森の中でシーザーに会ったウィルは、謝罪して家に連れ帰ろうと彼を説得する。

しかし、シーザーは、ここが家だと言ってウィルに別れを告げて、杉の大木に登り対岸の街を見つめる。

その後、今回の事件が暴徒による犯行だと発表される中、パイロットのハンシカーは、フライトのために空港に向うが、ターミナルで鼻血が出たことに気づく。

ハンシカーの搭乗する便は、ニューヨーク行きだった。