X-ファイル ザ・ムービー The X-Files (1998)

しかし、ミッショーは、爆弾に手も触れないまま、そのビルは爆破 される。

FBIの査問担当官ジェイナ・キャシディ(ブライス・ダナー)に呼ばれたモルダーとスカリーは責任を取らされ、彼女は転属を命ぜら辞職を考える。

気落ちするモルダーの元に、老医師アルヴィン・カーツウェル(マーティン・ランドー)が現れ、ダラスでのビル爆破事件の疑問を投げかける。

カーツウェルは、爆破されたビルのFEMA(連邦緊急管理局)の検疫施設にあった少年の遺体を、ミッショーを利用して、ある組織が爆破したことをモルダーに伝える。

その話を聞き流したモルダーだったが、スカリーを連れ出し、メリーランド州モントゴメリー郡に向かう。

二人は、海軍病院に保管されているダラスの遺体を調べ、爆破事件が自分達の過失でないことを証明するために、医師であるスカリーに、モルダーは遺体の解剖をさせる。

ワシントンD.C.に戻ったモルダーは、カーツウェルの元に向かうが、彼のアパートは既に警察の捜査が入っていた。

モルダーは街角でカーツウェルと出くわし、ダラスの遺体を放置すると、人類の未来までなくなる疫病が蔓延するということを知らされる。

その頃、遺体を解剖していたスカリーは、死因が感染であることを確認し、モルダーとダラスに向かうことになる。

スカリーは、病原体が未知のもので、すさまじい増殖力だということをモルダーに知らせ、例の洞窟でFEMAが発見した化石を調べる。

洞窟では、救急隊員の体内で徐々に成長していた生物が、科学者ベン・ブロンシュワイグ(ジェフリー・デマン)を殺害し、”シンジケート”は洞窟を密閉してしまう。

ロンドンでは、”シンジケート”のメンバーが招集され、洞窟の事態や天敵モルダーらの動きを察知する。

そして、コンラッド・ストラグホールド(アーミン・ミューラー＝スタール)らが、モルダーとカーツウェルの抹殺を企む。

洞窟は隠ぺい工作で姿を消し、モルダーとスカリーは子供達の情報で、謎のタンクローリー集団を追う。

不審なトウモロコシ畑に建つ施設に侵入した二人は、巨大な施設で蜂に襲われ、さらにヘリコプターに追われるが、何とか逃げ延びる。

スカリーは、ワシントンD.C.の審問会に出席し、化石のことなどを報告する。

モルダーはカーツウェルに会い、遺伝子操作でウィルスを花粉に組み込めば、蜂が媒介するという推理を彼に伝える。

スカリーは審問会の結果、ソルトレイクシティへの転任が言い渡されるが、彼女は辞表を出しモルダーに別れを告げる。

しかし、スカリーを説得したモルダーは、協力して事件解決に臨もうとした時、服に潜んでいた蜂が彼女を刺してしまう。

スカリーは倒れこみ、モルダーは救急車を呼ぶが、彼女は何者かに連れ去られ、モルダーは銃撃されてしまう。

スカリーは、”シンジケート”のシガレット・スモーキング・マン(ウィリアム・B・デイビス)の元に連れて行かれる。

一命を取り留めたモルダーは、監視下の病院を抜け出し、カーツウェルは”シンジケート”に抹殺される。

その後、”シンジケート”のウェル・マニキュアード・マン(ジョン・ネヴィル)はモルダーと接触し、スカリーを救えるワクチンと彼女の居場所を教える。

マニキュアード・マンは、ウィルスが何百万年も前に地球にやってきた異星人だということをモルダーに伝え、彼を解放するものの、裏切りを知られて車ごと爆殺される。

48時間後、南極のウィルクス・ランド。
スカリー救出に向かったモルダーは、ウィルス感染者の保管庫を発見し、その中からスカリーを見つける。

部外者の侵入を知った”シンジケート”は、警戒態勢に入るが、モルダーがスカリーに注射したワクチンで、システムが汚染されてしまう。

意識を取り戻したスカリーを連れ、地上に脱出したモルダーは、氷の中から出現した巨大な宇宙船を目の当たりにする。

その後、FBIの審問会は、事件の捜査を未解決のまま保留するが、スカリーはキャシディ査問官に、彼女が刺された蜂の死骸を渡す。

スカリーは、未知の敵に対し対処できる部署が、今のFBIにはないことを示唆して、その場を立ち去る。

テキサスの事件は、ハンタウィルスとして処理され、またしても何もかも葬り去ろうとする現実に、モルダーは幻滅するが、何か手立てがあるはずだという、固い決意のスカリーに励まされる。

チュニジアのタタウイヌ。
ストラグホールドとシガレット・スモーキング・マンは、砂漠の中の”シンジケート”のトウモロコシ畑で、モルダーが復帰し、”X-ファイル”が再開されたことを知る。